Les estimateurs

CensusIO dispose d’une bibliothèque d’estimateurs standards, regroupés selon la question à laquelle ils répondent. Chacun s’exécute automatiquement lorsque ses données sont présentes, et rapporte un intervalle de confiance à 95 % lorsqu’il en existe un.

Estimateurs regroupés selon ce à quoi ils répondent.

Abondance

Ceux-ci indiquent combien d’animaux sont présents, à partir de la capture d’un relevé. La marque-recapture et le retrait donnent une estimation par événement ; la capture par unité d’effort est un indice relatif regroupé sur plusieurs événements.

Marque-recapture : à partir d’animaux marqués et relâchés, puis d’une capture ultérieure dans laquelle certains sont recapturés. Renvoie une estimation d’abondance avec un intervalle de confiance à 95 % (l’estimateur de Petersen modifié par Chapman, qui est moins biaisé lorsque peu d’individus sont recapturés).
Retrait / dépletion : à partir de passages de retrait successifs (comme la pêche électrique) sur un tronçon fermé. À mesure que la capture diminue d’un passage à l’autre, le taux de déclin donne le nombre de départ. Deux passages utilisent une estimation sous forme close avec un intervalle ; trois passages ou plus utilisent un ajustement par maximum de vraisemblance (Zippin).
Capture par unité d’effort : un indice d’abondance relative à partir de la capture divisée par l’effort (nuits-filet, heures, nuits-piège). Rapporte à la fois le rapport des moyennes pondéré par l’effort et la moyenne des rapports par événement (avec un intervalle), qui répondent à des questions légèrement différentes.

Taille et condition (par individu)

Ceux-ci décrivent les animaux mesurés, sur l’ensemble des individus.

Fréquence des longueurs : un histogramme des longueurs en classes de taille de largeur fixe, pour que vous puissiez voir la distribution des tailles d’un coup d’œil.
Structure de taille (PSD) : le pourcentage de poissons de longueur de stock qui atteignent aussi la longueur de qualité, indexé sur des catégories de longueur standards. Voir Métriques halieutiques.
Poids relatif (Wr) : un indice de condition corporelle comparant le poids de chaque poisson au poids standard pour sa longueur et son espèce. Autour de 100, c’est la moyenne. Voir Métriques halieutiques.

Autres relevés

Prévalence de maladie (par individu) : la part des animaux testés qui sont positifs, avec un intervalle de confiance de Wilson à 95 % qui se comporte bien pour les petits échantillons et les valeurs extrêmes, et une ventilation par espèce facultative.
Échantillonnage par distance (par détection) : la densité à partir des distances des détections à une ligne de transect ou un point, en tenant compte des animaux manqués plus loin.
Biomasse (par parcelle) : le stock sur pied par unité de surface à partir de parcelles échantillonnées, mis à l’échelle de toute la zone d’étude, avec un intervalle issu de la dispersion entre les parcelles.
Prélèvement (par groupe) : à partir de groupes de contrôle de panier ou de prises, le prélèvement total, la moyenne par groupe, le taux de réussite (avec un intervalle de Wilson) et la capture par heure.